Общее собрание членов Ассоциации СРО «НОКК» является высшим органом управления Ассоциации СРО «НОКК».
Директор Ассоциации СРО «НОКК» является единоличным исполнительным органом Ассоциации СРО «НОКК» и избирается на должность Общим собранием Ассоциации СРО «НОКК» на срок 5 (пять) лет.
Совет Ассоциации СРО «НОКК» является постоянно действующим коллегиальным органом управления Ассоциации СРО «НОКК».
Контрольная комиссия, осуществляющая контроль за деятельностью кооперативов, членов СРО, соблюдением ими Закона № 223-ФЗ, иных федеральных законов, нормативных правовых актов Российской Федерации, нормативных актов Банка России, базовых стандартов, внутренних стандартов и иных принятых в СРО внутренних документов.
Дисциплинарная комиссия, рассматривающая дела о применении мер дисциплинарного воздействия в отношении членов СРО